Repêchage : Sélectionné en 26e ronde (794e au total) du repêchage amateur de 2005 par les Astros de Houston

Transactions :
30 octobre 2007 : Signe un contrat des ligues mineures avec les Royals de Kansas City

Saison 2005 (Tri-City)
Gradué de l’Université Santa Clara, où il a frappé dans une moyenne de .261 avec six circuits et 38 points produits en 52 parties, Thompson a amorcé sa carrière professionnelle avec le club-école A faible des Astros de Houston à Tri-City…Après des débuts plutôt lents, il a connu une solide mois de juillet (.288, 1 CC et 10 PP)…Il a joué presque exclusivement au troisième coussin…

Saison 2006 (Lexington/Salem)
Thompson a partagé son temps entre deux équipes de calibre A, évoluant au niveau A fort pendant un mois entre le 18 juin et le 15 juillet…Au niveau A moyen, Thompson a été plutôt ordinaire, ne conservant qu’une moyenne de .236 avec seulement quatre circuits, des chiffres décevants pour un frappeur de puissance…Après son retour dans la Ligue South Atlantic, Thompson n’a frappé que pour .154…Sa saison a pris fin prématurément en raison d’une blessure…À Lexington, il était le coéquipier du receveur J.R. Towles, le receveur d’avenir des Astros…

Saison 2007 (Burlington)
Libéré des Astros, Thompson a signé un contrat des ligues mineures avec les Royals de Kansas City et il a connu sa meilleure saison chez les professionnels…Grâce à sa récolte de 19 circuits en seulement 387 apparitions au bâton, il a terminé au quatrième rang de la Ligue Midwest à ce chapitre et il a dominé son équipe…Il a connu son meilleur mois en juin, frappant pour .253 avec cinq circuits et 18 points produits…Thompson a disputé 72 parties au troisième but, 15 parties au premier but et 21 rencontres comme frappeur désigné…

Saison 2008 (Wichita/Camden)
À sa première année dans le baseball indépendant, Thompson a terminé au premier rang de l’Association Américaine avec 29 doubles…Pour la première fois de sa carrière, il a conservé une moyenne supérieure à .300…Il a également franchi la dizaine de circuits pour la deuxième fois en deux ans et il a réussi son deuxième meilleur total de points produits en une saison en carrière…Puisque les activités de l’Association Américaine se terminent plus tôt, Thompson a été prêté à Camden de la Ligue Atlantic…Il n’a cependant pas été en mesure de conserver la cadence qu’il avait à Wichita…

Saison 2009 (Wichita)
À sa deuxième saison à Wichita, Thompson a encore consolidé sa réputation de solide frappeur de doubles avec 32, un sommet personnel. Il s’est situé au deuxième rang à ce chapitre dans l’Association Américaine…En 94 parties au troisième but, Thompson a conservé un excellent pourcentage défensif de .967, ne commettant que 10 erreurs…

Saison 2010 (Capitales de Québec)
Thompson a débuté la saison à Wichita, dans l'Association Américaine, avant d'être échangé vers la mi-saison aux Capitales. En retour, les Capitales ont troqué le joueur d'avant-champ Mike Bell, qui ne pouvait se présenter à Québec...Même s'il n'a joué qu'une cinquantaine de parties, Thompson a terminé ex-aequo au premier rang  des Capitales avec une récolte de 17 doubles...Il a su camper de belles façons les crampons de Patrick Deschênes au troisième coussin... Le 17 août, en compagnie de Sébastien Boucher et de Pierre-Luc Laforest, il a participé à trois circuits consécutifs, un exploit plus que rarissime...Il a connu deux parties de quatre points produits, soit le 15 août et le 18 août...En séries éliminatoires, il a frappé pour une moyenne de .241 avec un point produit...

Honneurs individuels
2007 : Frappeur désigné étoile de la Ligue Midwest